Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PODXLO00592 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXLO00592 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXLO00592 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXLO00592 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXLO00592 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXLO00592 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXLO00592 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXLO00592 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXLO00592 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXLO00592 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PODXLO00592 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PODXLO00592 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PODXLO00592 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXLO00592 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXLO00592 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXLO00592 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXLO00592 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXLO00592 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXLO00592 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXLO00592 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXLO00592 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PODXLO00592 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PODXLO00592 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXLO00592 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXLO00592 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXLO00592 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXLO00592 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXLO00592 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXLO00592 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXLO00592 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXLO00592 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms