Protein–RNA interactions for Protein: I6L890

Casp16-ps, Caspase 16, apoptosis-related cysteine peptidase, pseudogene, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp16-psI6L890 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp16-psI6L890 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Casp16-psI6L890 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms