Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms