Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm29394H3BIW7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm29394H3BIW7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms