Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5861F6VCN9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5861F6VCN9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5861F6VCN9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm5861F6VCN9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5861F6VCN9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm5861F6VCN9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5861F6VCN9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5861F6VCN9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms