Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc146E9Q9F7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms