Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
5430401F13RikE9Q328 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
5430401F13RikE9Q328 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms