Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930455H04RikD3Z622 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930455H04RikD3Z622 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms