Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc11B2RXC1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms