Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms