Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otud4B2RRE7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms