Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phf3B2RQG2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf3B2RQG2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms