Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms