Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-2A0A140T8N6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trbv13-2A0A140T8N6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trbv13-2A0A140T8N6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trbv13-2A0A140T8N6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv13-2A0A140T8N6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Trbv13-2A0A140T8N6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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