Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mbd1Q9Z2E2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd1Q9Z2E2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms