Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pf4Q9Z126 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pf4Q9Z126 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms