Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHB6Q9Y5E3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB6Q9Y5E3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms