Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msl3Q9WVG9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msl3Q9WVG9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms