Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GALPQ9UBC7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GALPQ9UBC7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms