Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N7

Syt7, Synaptotagmin-7, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt7Q9R0N7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Syt7Q9R0N7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Syt7Q9R0N7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Syt7Q9R0N7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Syt7Q9R0N7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Syt7Q9R0N7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Syt7Q9R0N7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Syt7Q9R0N7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Syt7Q9R0N7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt7Q9R0N7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms