Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp1Q9QY53 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nphp1Q9QY53 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms