Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Kcnip3Q9QXT8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kcnip3Q9QXT8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms