Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim44Q9QXA7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim44Q9QXA7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim44Q9QXA7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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