Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tgm1Q9JLF6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Tgm1Q9JLF6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Tgm1Q9JLF6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms