Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upk3aQ9JKX8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms