Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcan3Q9JKK0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms