Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Riox1Q9JJF3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms