Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ube3bQ9ES34 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3bQ9ES34 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3bQ9ES34 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms