Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SelenofQ9ERR7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenofQ9ERR7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms