Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms