Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim23Q9DAL0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim23Q9DAL0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms