Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2e2Q9D902 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.1 ms