Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms