Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem54Q9D7S1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms