Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmigd1Q9D7L8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmigd1Q9D7L8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms