Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrameQ9D4Z5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrameQ9D4Z5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms