Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sohlh2Q9D489 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sohlh2Q9D489 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms