Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Urm1Q9D2P4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Urm1Q9D2P4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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