Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdhd3Q9CYW4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms