Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd4Q9CWX4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd4Q9CWX4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms