Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn1Q9CWM4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms