Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930524J08RikQ9CUJ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms