Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NmbQ9CR53 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NmbQ9CR53 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms