Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufb9Q9CQJ8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms