Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCSER1Q9C0I3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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