Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM9Q9C026 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM9Q9C026 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms