Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms