Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1Q99N20 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brms1Q99N20 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brms1Q99N20 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms