Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc12a9Q99MR3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc12a9Q99MR3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms