Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KarsQ99MN1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms